正視台灣四面環海的事實，積極回應政府建立「海洋國家」、設立「海洋部」的急切需求，提供符合國際潮流和國內需要，具有國際觀和整合觀的教育新方向，造就因應國家未來永續發展所需的人才。依據教育部來函指示，為配合「國家重大政策」之規劃，提出增設海洋科技與海洋事務整合相關研究所。

        海洋事務相關研究所的成立涉及領域甚廣，涵蓋海岸管理、航運政策、漁業政策、環境經濟及資源管理等，為跨學院整合之增設。本所獲教育部核准成立之初，主要由本校內部四個單位(工學院－水利及海洋工程學系、系統及船舶機電工程學系；管理學院、社科院－法律系)經過多次規劃及籌備，遂於95年8月1日正式成立本所－海洋科技與事務研究所。本所課程規劃，除了上述各系所合作之支援教師外，並以跨校合聘教師方案，充實海洋事務領域專業師資。